在农业发展早期，人类一直培育庄稼直到它们长大些、更富有营养，但是基因操作不是促进植物生长的唯一方法。9月25日在著名刊物《微生物学趋势》上发表的评论文章上，2个综合性生物学家展现了怎样设计植物土壤微生物来改善植物生长，即使植物在基因方面是一样以及不能进化发展。这些人工选择的微生物可以从父母遗传到后代。
只有一些发表的研究已经注意到人工选择微生物的影响。在他们自己的实验室中，作者——德州大学奥斯汀分校的乌利齐•米勒（Ulrich Mueller）以及加利福尼亚大学的乔•萨克斯（Joel Sachs）看到了微生物工程在拟南芥实验的成功。在拟南芥实验中，采用过滤器捕获最大植物根系的细菌，然后通过种子供给其他植物的生长。随着时间的发展，这些植物（基因相同、不能自我发展的植物）因为进化和改善后的微生物生长地很好。
米勒表示：“我希望其他人会对其他系统的优化感兴趣。对于农业应用而言，我会在温室环境中人工选择根系微生物进行实验，使用如生菜、黄瓜或西红柿这样的经济作物，从这些温室实验中学习经验，然后估量这些原则能否应用到户外农业和园艺中。”
微生物实验因为其在植物或动物之间繁衍整个微生物群落的复杂性显得很棘手，会影响生产能力。草和蜜蜂是很棒的测试生物的原因是他们的微生物能被操控进行遗传。通过在有稳定基因的生物中测试这一点，很容易看到增加细菌区的影响。
米勒表示：“相对于杀虫剂和抗生素或转基因生物而言，选择人工微生物会是帮助控制植物和动物疾病的一种较廉价的方法。宿主中介人工选择根系微生物的方法是超级简单的，任何地区的农民都能针对特定区域的特定问题设计微生物，促进种植物的生长。”
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