21世纪初，人类对基因组认识的巨大进步带动了一批生物技术公司的兴起，现在这种情况也发生在微生物领域。随着人们对“体内微生物如何影响健康”这一知识了解的增多，有一批生物公司出现，开始在这个领域创业。
微生物与人体健康
人类基因组计划在2003年完成以后，许多科学家认识到解密人类基因组基因并不能完全掌握人类疾病与健康的关键问题，因为人类对自身体内存在的巨大数量的，与人体共生的微生物菌群几乎一无所知。人体内微生物细胞的数量是人体内细胞数量的10倍，初步的研究显示其所含基因数目的总和是人类基因组所含基因数目总和的100倍。在这些微生物里，以肠道中的微生物数量最多、种群最丰富，大约80%的人体正常微生物都集中在这里。
从2004年开始，就有科学家陆续发现人体微生物特别是肠道菌群与健康有密切关系。Nature、Science、PNAS等杂志几乎每年都刊登相关论文，2013年肠道菌群研究更成为热点。
2013年7月，发表在Nature上的一篇论文表明，肠道内有17种细菌能帮助人体调节失衡的免疫功能，防止出现炎症（Nature：17种肠道微生物能防炎症）；Science Translational Medicine上一篇论文表明，肠道细菌或加速HIV患者病情及炎性反应。12月，两项刊登在Science上的研究报告称，生活在我们肠道中的细菌群落可帮助确定某些抗癌疗法的功效，其中包括那些先前被认为直接作用于肿瘤细胞的药物（Science：人类肠道微生物群有多稳定?）（Science：肠道微生物通过性激素来影响自身免疫风险）。而且肠道不同区段，微生物结构也不相同（PLoS ONE：胃肠道不同区段的微生物群落结构特征组成），肠道微生物与肿瘤发生也相关（J Natl Cancer Inst.:肠道微生物组降低与结肠癌有关）
我国在这一领域研究地比较深入的是上海交通大学赵立平教授。赵立平2005年开始做肥胖与肠道菌群研究，2006年开始有意识地调整自己的饮食结构，同时对自己的体重以及肠道中的菌群进行监测。两年时间内， 赵立平减掉了 40斤，腰围减小，血压、心率、甘油三酯、胆固醇等指标都降低，恢复正常。2010年6月，赵立平的减肥故事登上了Science杂志（Science:人类肠道微生物改变了小鼠的代谢）。
根据以上研究可以看出，微生物与人体健康有着密切的关系。当人体微生物群体紊乱时，可能会导致某些疾病——虽然两者之间的关系还没有完全弄清楚，但谜底已经在逐步揭开。
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