中国科研人员采用比较基因组学方法，历经6年多的努力，终于找到了引起伤寒病的沙门氏菌来自不同的直系祖先。
据哈尔滨医科大学基因组中心主任刘树林教授介绍，伤寒病是一种急性传染病，需要及时治疗，否则可危及生命。1881年，人类首次从伤寒病人身上分离到了伤寒沙门氏菌。后来，又陆续分离到甲型副伤寒沙门氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌和丙型副伤寒沙门氏菌，并确定这四种不同的病菌都能引起伤寒病。
这四种病菌来自于共同祖先，还是各自独立形成的？这个问题的澄清对研究传染病致病因子的起源、进化和控制有着重要意义。
2002年，刘树林教授带领的课题组开始对丙型副伤寒沙门氏菌进行基因序列分析。他们利用上世纪90年代初建立起来的独特方法，即高分辨率基因组物理图构建技术，先制作了一幅基因组“略图”，勾勒出了该细菌基因组的框架，然后在此基础上进行序列的组装。这种基因组“略图”能够表现基因组的大致形状和基因之间的相互关系，大大降低了基因序列分析所需的成本。
利用这种方法，课题组对3种伤寒病致病菌所共有的3000多个保守基因进行比较，构建出了反映它们之间亲缘关系的系统发育树。
在刘树林课题组构建的系统发育树上，伤寒沙门氏菌和丙型副伤寒沙门氏菌居于树枝的两端，同时，丙型副伤寒沙门氏菌与猪霍乱沙门氏菌（不引起人的伤寒病）共居一枝的枝梢。
这些大量翔实的数据给出了清晰的结论：导致伤寒病的细菌，不是由共同的直接祖先进化而来，而是各自分别获得了有关遗传性状最后发展成侵袭人体并造成伤寒病的特殊病原体。这一研究成果于今年2月份发表在国际著名期刊PLOSONE上。
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