以前所述的检测方法并非完全适用于菌种的鉴定。因为在用平皿 上培养的菌体制作染色涂片时，几乎都要造成孢子结抅不同程度的变形、裂解，或造成假 菌丝体或菌丝体断裂为分生孢子。所以在检测霉菌和酵母菌时，最好用载玻片培养菌体， 这种培养方法造成孢子变形和断裂的几率很小。即使是同样用载玻片培养霉菌和酵母 菌,生成菌丝体时的形态也有所不同。短梗霉、地霉内孢 霉和假丝酵母等真菌，在结构上介于酵母菌和菌丝体真菌之间， 初次分离时，因培养基、温度和培养时间等条件的不同,会兼有酵母菌和霉菌共同的菌落 特征。在分离培养过程中若菌体既形成真菌丝体，又与酵母菌有相似的生长状态吋，建议 做进一步鉴定,这时应同时使用霉菌和酵母菌的玻片培养法培养菌体。
除了使用载玻片培养外，也可在多种平板培养塞中进行真菌的培养。因为不同的真菌对营养的要求变化很大，使用不同种的培养基可促使不同真菌形成孢子：常用的培养 基有酵母膏琼脂、Czapck-Dox琼脂、马铃薯葡萄糖琼脂和Davis酵母盐琼脂。每次至少 使用两种培养基，其中一种含较高的碳水化合物，另一种含量则较低。培养时将平板置于25℃或其他所需的温度培养，用入射光体视显微镜每隔一天观察次，持续观察两周。因食品中很多常见霉菌的孢子在被吸入人体后会导致过敏性反应或肺部感染，因此在进行 孢子培养的操作时应格外小心。
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