两者在形态结构方面有显著区别，进化程度不同原核生物出现在生物界早于真核生物。

特　征	真　菌	细　菌	放线菌
细胞形态	显著分枝、多细胞	单细胞	显著分枝单细胞
细胞核	真核（核膜）	原核	同
细胞质	有线粒体、内质网	无	同
细胞膜	固醇	无	同
CW	酵母菌：常聚糖、甘露聚糖 霉菌：几丁质（少量纤维素）	肽聚糖、土豆酸	肽聚糖、二氨基庚二酸、
对药物敏感性	对磺胺、青霉素、四霉素、氯霉素、链霉素、不敏感	与真菌相似	同
生长PH	偏好性	中性或微碱	同
繁　殖	酵母菌：芽殖为主 霉菌：有无性孢子	裂殖	产生无性孢子为主

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