自然界中还有许多高等植物的根与土壤中的真菌形成共生关系，这种同真菌的共生体称为菌根(mycorrhiza)。根据菌根形态学及解剖学特征，可将菌根分为外生菌根(ectotrophic mycorrhiza)、内生菌根(endotrophic mycorrhiza)和内外生菌根(ectendotrophic mycorrhiza)三种类型。

     (一)外生菌根

     与根共生的真菌菌丝体包围宿主植物幼根外表，形成菌丝鞘，菌丝一般不穿透组织细胞，而仅在细胞壁之间延伸生长(图4-45)。形成菌根的根一般较粗，顶端分为二叉，根毛稀少或无。这类菌根只有少数植物如松科、桦木科、山毛榉科、杜鹃花科等植物形成这类菌根。

     (二)内生菌根

    真菌菌丝分布于根皮层细胞间隙或侵入细胞内部形成不同形状的吸器，如泡囊和树枝状菌丝体。因此。内生菌根也称泡囊-丛枝(VA)菌根或丛枝菌根(AM)(图4-46)。这类菌根宿主植物的根一般无形态及颜色变化。90%以上的植物都能形成内生菌根，典型的内生菌根如兰花菌根。

     (三)内外生菌根

     有外生菌根和内生菌根的某些形态学或生理特征。它既可在宿主植物根表面形成菌套，又可在根皮层细胞间隙形成VA菌根，亦可在皮层内形成不同形状的菌丝圈。内外生菌根主要发生于松科、桦木属、杜鹃花科以及水晶兰科植物上。

   

   

    真菌是低等的异养植物，它不能自己制造有机物，与绿色植物共生后，真菌可以从根中得到它生长发育所需的碳水化合物，而菌丝如同根毛一样，可以从土壤中吸收水和无机盐供植物利用，促进细胞内贮藏物质的分解，增进吸收作用。菌丝还能产生激素，尤其是维生素B1和B6等生长活跃物质，不仅对根的发育有促进作用，使植物生长良好，还能增加豆科植物固氮和结瘤率；提高药用植物的药用成分含量；提高苗木移栽、扦插成活率等。如松树在没有与它共生真菌的土壤中，生长缓慢甚至死亡。因此，在林业上，常用人工方法进行真菌接种，提高抗旱能力，以利于造林成功。
    

    现已发现在根上能形成菌根的高等植物有两千多种，其中很多是造林树种，如银杏、桧、侧柏、毛白杨和椴树等。

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