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质粒DNA提取及琼脂糖凝胶电泳检测(上)



录入时间:2011-9-9 16:22:24 来源:生物在线

一、碱变性法提取质粒DNA

质粒(Plasmid)是细菌染色体外能自身独立复制的双股环状DNA。带有遗传信息,可赋予细菌某些新的表型。将质粒指纹图谱分析方法、质粒 DNA探针技术及检测质粒的PCR技术用于临床感染性疾病的诊断和流行病学调查已成为现实。质粒作为载体在基因工程中起着重要的作用。

分离和纯化质粒DNA的方法很多,但这些方法基本包括三个步骤:即细菌的培养和质粒DNA的扩增;细菌菌体的裂解;质粒DNA的提取与纯化。

本实验学习用碱变性方法提取质粒DNA 。

【原理】

细菌培养物加入SDS和NaOH碱性溶液处理后,菌体裂解,可使细菌的质粒DNA、染色体DNA和RNA一起从细胞内释放出来,经琼脂糖凝胶电泳,因各种核酸分子的迁移率不同将上述核酸分成不同的带。用溴化乙锭(EB)染色后,在紫外线灯下可看到各种核酸带发出的荧光。根据荧光的位置,可区分不同的核酸带。

【材料】

1、菌株E.coliJM109(pUC19),E.coliRRI(pBR322)

2、试剂溶液Ⅰ(50mM葡萄糖,25mMTris.HclPH8.0,10mMEDTA)
      溶液II(0.2NNaOH,1%SDS)用前新配制
      溶液III(5mMKAc溶液,PH4.8)
      TE缓冲液(10mMTris.Hcl,1mMEDTA,PH8.0)
      LB液体培养基(胰蛋白胨10g,酵母粉5g,Nacl10g,加蒸馏水溶解,用NaOH调PH至7.5,加水至1000ml,15磅高压灭菌15分钟。)

【方法】

1、接种细菌于5mlLB液体培养基中,37℃培养过夜。

2、3000rpm/min,离心15min,弃上清。加入100ul溶液Ⅰ悬起细菌沉淀。

3、加入200ul前新配制的溶液II,颠倒EP管5次混合均匀,置冰浴2min。

4、加入150ul溶液III温和地混匀,12000rpm/min,离心5min。

5、吸取上清清亮裂解液放入另一新EP管中,加等体积酚-氯仿-异戊醇抽提2次,12000rpm/min,离心2min。(若不做酶切,此步可省略)吸取上清放入另一新EP管中,加入二倍体积的冷乙醇,12000rpm/min,离心10min。

6、弃乙醇,干燥后用30ulTE缓冲液洗下核酸,待电泳检测。

 

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