1 最简单的:用枪尖或者牙签从平板或液体中沾少量菌(多了就会影响反应了,沾上点就够了),直接加入到PCR体系中反应就行了,依靠变性温度来破裂细菌释放DNA。
2 其它方法:用枪尖或者牙签沾少量菌,加入到没有加酶的PCR反应体系中,沸水浴5min,冷却后加入酶,开始反应,有些不容易加热破裂的菌预先煮沸一下,可以释放更多的DNA,有利于PCR反应。
3 用Chelex,一些实验室做菌种鉴定的时候习惯用的方法:可以去除一部分杂质,降低PCR反应所受的干扰。
1) 5%-10%chelex 50μl(配法:5-10g chelex 加入100ml TE)+菌苔,在管壁适当研磨,震荡混匀,短暂离心
2) 煮沸:细菌5min,放线菌10-15min
3) 冷却至室温,10000-12000rpm离心5-8min,取上清扩增
注:chelex方法适于细菌、放线菌,chelex提前在65摄氏度水浴中预热,溶液有细小颗粒,吸取时枪尖最好先剪掉,否则不好吸。
这3个方法由简到繁,效果当然是依次提高了。这样的直接以细菌为模板进行PCR反应,特别是前两种,适用于大量的筛选和验证,由于加入了细菌本身的其他物质以及难免引入的培养基成分,可能会对PCR反应造成干扰,假阳性假阴性都是可能出现的,所以之后最好还要进一步验证。chelex方法可以去除一定的杂质,干扰较小,但是毕竟也不如直接以DNA为模板效果好。实验者可以根据自己的实际需要来选择合适的方法。
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