苯酚/氯仿溶液抽提法
1. 接种5ml LB,37℃摇床过夜培养(12小时)
2. 离心,3000rpm,5min去上清
3. 振荡混匀沉淀,分装在2个离心管中,spin一下,吸去上清,加入150μl的溶液I (50mmol/L葡萄糖, 25mmol/L Tris•Cl(PH8.0), 10mmol/L EDTA(PH8.0) 在10lbf/in2(6.895×104Pa)高压蒸气下灭菌15min(8磅),贮存于4℃),剧烈振荡5分钟打散菌体(菌体不打散容易在产物中出现较多蛋白)。
4. 加入300μl溶液II(0.2mol/LnaOH, 1%SDS, 用2倍的溶液现配现用)后立即振荡混合均匀,处理2分钟后加入225μl溶液III(5mol/L乙酸钾 60ml,冰乙酸 11.5ml,水 28.5ml)混合均匀,12000rpm离心5min,取上清液中于新的离心管。
5. 加120μl酸性苯酚/氯仿溶液,振荡混匀,12000rpm离心5min,再取上清液中于新的离心管中。
6. 用120ul氯仿重复操作5。
7. 加等体积的异丙醇或2倍体积的乙醇,混匀,12000rpm离心7min。
8. 沉淀用70%乙醇洗涤两次,每次10min。50℃烘干后加适量无菌去离子水(ddH2O)溶解,-20℃保存。
氯化锂抽提法
1. 前四部同苯酚/氯仿溶液抽提法(用Solution I II III处理)
2. 加等体积的异丙醇,混匀,沉淀DNA,12000rpm离心7min。去上清,尽量去干净。
3.用少量70%乙醇洗一下(洗去异丙醇),离心去尽酒精,50℃烘干沉淀,用适量ddH2O(100ul)充分溶解(可在50度水浴中助溶)后加入4/5体积的氯化锂溶液(浓度约10mol/L)处理1min沉淀RNA和蛋白。
4.12000rpm离心5min,取上清液于新的离心管中,用等体积的异丙醇混匀,12000rpm离心8min,去上清。
5. 将沉淀用70%乙醇洗涤两次,每次10min。50℃烘干后加一定量的无菌去离子水(ddH2O)溶解,-20℃保存。
酶连反应
一般采用10μl反应体系:
T4连接酶 1μl ,连接酶缓冲液1μl ,外源片段与载体按DNA 摩尔含量3:1加入即可。
如果是粘端连接,则需把外源片段和载体的混合物在50度处理10分钟使粘端变性,然后立即放入冰中5分钟。
平端连接采用14度,粘端连接采用16度,连接4小时以上(一般可过夜)。
*外源片段与载体按DNA 摩尔含量为3:1或外源更多。
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