酵母遗传学方法
1)总酵母RNA的分离
1.在每毫升培养物中加入50μg环乙酰亚胺,在30℃下振荡15分钟。此步亦可省略,但是有人认为环乙酰亚胺可防止mRNA凝集在多核糖体上。
2.迅速冷冻收集细胞,在大离心管中加入约一半体积的碎冰,将培养物倒入,振荡,在4℃下以5000r/min离心5分钟。
3.加入11g玻珠于30ml离心管中,以Corex玻璃离心管为最佳,不过塑料离心管也能使用。
4.加入3ml已用LETS缓冲液平衡的苯酚到玻珠中。
LETS缓冲液:
0.1 mol/L 氯化锂
0.01 mol/L Na2EDTA
0.01 mol/L Tris-HCl (pH7.4)
0.2% SDS
0.1% 二乙基焦碳酸(可任选)
5.用2.5ml冰预冷的LETS缓冲液悬浮细胞,并将其加入到上述玻珠苯酚管中。为了使细胞破碎的最好,液面应刚好高于玻珠表面。
6.高速振荡30秒后,在冰上置30秒,交替进行3分钟,用相差显微镜检测细胞破碎情况,破碎的细胞呈现无折射的空细胞。
7.当至少90%细胞破碎后,用5ml冰预冷的LETS缓冲液,轻微振荡,用Sorvall SS-34转头以8000r/min离心5分钟,使溶液分相。离心后,酚层和蛋白质界面应刚好低于玻珠表面,移出水相而不会触动界面。
8.将水相转到一个干净离心管,用5ml苯酚:氯仿:已戊醇(25:24:1)抽提2次,避免触动界面。用氯仿抽提一次。
9.加入1/10
体积的5mol/L氯化锂,在-20℃下沉淀3小时。此时,RNA沉淀可在-20℃下存放。
2)Poly(A)+RNA的分离
1.将保存的RNA用Sorvall SS-34转头以10 000r/min离心10分钟,收集RNA沉淀,用80%乙醇洗涤。真空干燥后,溶于2.5ml蒸馏水中,溶解后加入2.5ml 2×上样缓冲液,同时加SDS至终浓度为0.3%。
2.置65℃保温5分钟。
3.装一个oligo(dT)柱,用1×上样缓冲液洗3次。
4.用10mmol/L HEPES(pH7)洗脱Poly(A)+RNA。如果希望得到更满意的结果,可用加入RNase抑制剂。
5.用蒸馏水对Poly(A)+RNA进行10倍稀释,通过OD260的光吸收测定RNA浓度。用水将10mmol/L HEPES(pH7)稀释10倍作为对照。
6.加1/10体积3mol/L醋酸钠和2.5倍体积的无水乙醇沉淀RNA,上下倒置混匀,在-70℃下放置30分钟。离心10分钟,弃上清液,用水溶解RNA沉淀使终浓度为1mg/ml。不管是溶解的RNA或是乙醇沉淀的RNA都能在-70℃下长期保存。
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