细胞的冻存过程需要一系列程序降温，一般4℃下存放30 min，转放-20℃ 1 hour，再转入-70至-80℃过夜，之后才可以转移到液氮内(-196℃)，这时就必须配备一台-86℃超低温冰箱。一般超低温冰箱保存细胞可达数月，对于不需要长期冻存的细胞，可暂时放于超低温冰箱保存。

从液氮或超低温冰箱中取出细胞冻存管需要立即放于37℃水浴中快速复苏之后才传代培养，因此，恒温水浴也是细胞实验室必备仪器。

细胞培养需要离心收集传代细胞，所以需要配置低速的常温离心机，对于后期细胞内容物的分离则需要高速冷冻离心机。

细胞实验中有大量频繁的移液操作，因此各种微量移液器、瓶口分配器、移液管控制器是必不可少的。各类细胞培养板、细胞培养瓶、移液管等耗材更是不可或缺的，而且一次性，用量极大。

除上述仪器外，高压灭菌锅、倒置显微镜也是细胞培养的必备仪器，发酵罐、转瓶机等也常常见于细胞培养实验室。