四、基因片段转移技术
大肠杆菌CaCl2法制备感受态细胞及DNA转化
1. 挑取保存的感受态细胞在LA平板上划单菌落。
2. 挑取长好的单菌落接入到装有5ml LB的universal瓶中,摇床过夜培养。
3. 从universal中取1ml过夜培养物,转接于装有20ml LB(用SOC或SOB可提高感受态效率)的250ml三角瓶中,培养2.5~3小时至OD600=0.6
4. 将培养物倒入50ml已预冷的大离心管中,置于冰上待冷却
5. 离心,4℃.5000rpm.3分钟
6. 倒去上清液,先加少量0.1M CaCl2 ,打散沉淀,再加10ml,混匀,于冰上放置至少30分或过夜。
7. 离心,4℃.5000rpm.3分钟
8. 弃上清,加1ml 0.1M CaCl2,在冰上轻轻打散沉淀,即可使用。
以上步骤均需注意无菌和低温操作。
1. 取100μl感受态细胞和5μl的酶连产物或1-2ul质粒混合
2. 冰上静置30分钟
3. 42℃热激90秒,然后在冰上放置5min
4. 加0.75ml LB培养基,在37度摇床上培养45分钟。然后3600转离心2分钟,去掉大部分上清。(此步不作为快转,作为慢转,慢转可提高效率,有些抗生素如Kan筛选时用慢转较好)
5. 涂布于有抗生素的筛选平板,一般12小时可有转化子出现。
1. 从转化子平板上挑取单菌落,在另一平板上划小方块,37℃扩大培养12小时
2. 刮取适量(偏少)的菌体悬浮于30μl快检液I溶液中振荡均匀
3. 加入15μl碱性SDS溶液(0.3mol/L NaOH, 2%SDS)(天冷时先使该溶液预热),立即振荡混合完全。
4. 在70℃放置15min(对大于20kb的质粒则最好放在55℃, 30min)水浴时间不宜过长。
5. 冷却至室温,直接上样跑琼脂糖凝胶电泳检测(如果菌体过多,则点样时会发现样品很粘,所以掌握不好时可以在第4步之后加上一部5ul苯酚抽提,离心的步骤。)
* 如果没有用苯酚处理,看胶时会发现很明显的总DNA的条带,但不影响实验结果的观察。
* 点样时注意点上质粒载体质粒对照,一般在快检时会出现质粒CCC构型的条带,有时也会出现OC构型的。
* 快检液I:0.3M蔗糖,25mM pH8.0 Tris-HCl,0.5mM EDTA,0.02%溴甲酚绿
1.带有oriT的目的质粒转化进入大肠杆菌ET12567( pUZ8002),得到转化子;
2. 将转化子的过夜培养物转接在LB中,在合适抗生素下,37 oC培养转化子,到合适浓度(OD600:0.4-0.6)收集菌体;
3. 用等体积新鲜的LB洗涤菌体两次(洗掉抗生素), 0.1倍体积的LB悬浮.备用;
4. 链霉菌孢子的热激和预萌发(一般的接合转移只须做热激)
(1)新鲜孢子悬浮于5ml 0.05M PH8.0 的TES;
(2)50ºC水浴热激10分钟;
(3)冷却到室温后加入等体积2X孢子预萌发培养基;
(4)37ºC摇床分别培养2-3小时;
(5)离心收集孢子并重新悬浮于适量的水或TES中;
(6)在振荡器上打散孢子
或只作热激按下面步骤:将适量的孢子加入1ml SOC或2倍YT培养基,50度处理10分钟,离心,去大部分上清。
5. 按(1*e-8):(1*e-9)与3中的大肠杆菌混匀(不一定)
6. 30ºC培养13-20小时左右用适当浓度的抗生素和萘啶酮酸(抑制大肠杆菌)覆盖
6. 30ºC培养数天(一般2天)可得到接合转移子.
7. 挑选接合转移子到含适当抗生素和萘啶酮酸的平板上, 验证;
(作筛选双交换菌株时继续作下面步骤)
8. 直接将得到的接合转移子作影印,寻找单抗的菌株即为双交换菌株。如果得不到,就要通过单交换菌株的松弛培养来得到双交换菌株。得到的单交换接合转移子划线
于合适的培养基(含萘啶酮酸,不含别的抗生素)松弛培养;
9. 得到的孢子或菌体稀释涂皿或划单菌落(for Bld菌株), 影印筛选双交换.
注意事项:
1 不同的孢子热激的温度和时间不同,预培养的时间不同.
2 不同的链霉菌接合转移所用的培养基不同
预萌发培养基
Difco 酵母膏 1%
Difco 酪蛋白氨基酸 1%
CaCl2 0.1M(需配制5M的原液,分开灭菌后加到酵母膏/酪蛋白氨基酸溶液中去)
链霉菌原生质体的制备
1. 在装有不锈钢弹簧的三角瓶中加入250ml的YEME+TSBY(1:1)(一定要加Glycine),接种100ul的孢子悬液,于30度摇床中培养36~40 hr(视具体情况,有时培养24h已足够。)。
2. 将培养物倒入universal中,用无菌水涮洗三角瓶,收集洗液于同一universal中,然后3000 rpm离心10 min。
3. 弃上清,将菌丝体悬浮于15 ml的10.3%的蔗糖溶液中,3000 rpm离心10 min,弃上清。同此法洗两次。
4. 取1 ml菌丝体,加入4 ml的溶菌酶溶液(溶菌酶母液为50mg/ml P Buffer,终浓度为2 mg/ml,用P Buffer稀释),于30度水浴30~60 min(间隔七八分种轻轻摇动)至上清呈乳状。
5. 加入5 ml的P Buffer并用5 ml的吸管吹吸几次,继续温浴10 min。(使大量的原生质体释放出来。)
6. 用装有脱脂棉的试管过滤,滤液转入无菌干净的universal中,3000 rpm离心7 min(不用brake档防止其破裂)。原生质体沉淀呈黄色。
7. 弃上清 ,轻柔打散原生质体,用P Buffer洗两次(洗去溶菌酶)。每次仍使用3000 rpm离心7 min。(此步可省略)
8. 弃上清,用枪将原生质体打散,分装,于-70度保存。
注:1.. P缓冲液(原生质体转化用)(Okanishi, 1974)
蔗糖103g,K2SO4 0.25g, MgCl2·6H2O 2.02g, 微量元素溶液 2ml,蒸馏水 800ml
灭菌后每80ml上述溶液中加入:0.5% KH2PO4 1ml, 3.68% CaCl2·2H2O 10ml, 5.73% TES 缓冲液(pH7.2) 10ml
2.溶菌时间不能过长,否则会使原生质体破裂。离心后若看到很粘的絮状物,则说明原生质体破裂。
1. 将最多5 ul的DNA(质粒或酶连产物)加于已经装有50 ul原生质体的指型管(1.5 ml)的管壁上(不与原生质体接触)。
2. 吸取200ul的25% PEG4000(PEG应先灭菌,再用P Buffer配置),将DNA冲入原生质体中,小心抽吸几次使之混匀。
3. 将混合物涂布于R5平板上(不含任何抗生素)。
4. 30度培养14~20 hr后(待原生质体再生后,即平板呈雾状),用含有适当抗生素的1 ml无菌水溶液覆盖。
5. 再培养1~2 d后,可以看到小的转化子菌落长出。
1. 将天蓝色链霉菌库斯质粒转化进入大肠杆菌BW25113/pIJ790*菌株中,此步可用常规的CaCl2 法。(pIJ790带有cat基因和对温度敏感的复制区,培养时温度要严格控制在30゜C以下)
2. 培养含库斯质粒的BW25113/pIJ790菌株:从平板上挑取大肠杆菌单菌落接入5ml 含25ug/ml Cml,100ug/ml Amp的SOB-MgSO4 (不加MgCl2 的SOB中加入MgSO4至20mM )中,30゜C摇床培养过夜。
3. 取一部分过夜培养物至25ml新鲜的SOB-MgSO4 培养基(含25ug/ml Cml,100ug/ml Amp)中,菌体终浓度为1% ,添加250ul 1M L-阿拉伯糖诱导λ/red 重组系统。
4. 30゜C ,200rpm摇床培养3-5h 至OD600~0.6 。
5. 将培养物倒入预冷的30ml离心管中,冰上置10min(从此细胞温度要保持在0~4゜C)。4000rpm 4゜C离心 5min。
6. 弃掉上清,加1ml预冷的10%甘油,在冰上打散沉淀,再加9ml 10%甘油,摇匀。
7. 4000rpm 4゜C离心 5min,弃掉上清,用10%甘油洗涤。重复上面操作:4000rpm 4゜C离心5min,尽量弃去上清,用残留液将细胞打散。(感受态细胞浓度越高电转效果越好)
8. 在预冷的0.2cm的电转化杯中混合50ul感受态细胞与1-2ul PCR产物(经纯化,可尽量浓,但不能加得过多),混匀后立即电击,电击条件:200Ω,25uF,2.5kv, 电击结果为4.5~4.9ms 较理想。(电转化杯在70%乙醇中保存,用前先在无菌环境下用无水乙醇洗一下,再吹干,放冰上预冷,无水乙醇能加快吹干的速度。也可以选择0.1cm的电转化杯,但电击的参数就得变为:1.8 kV,?Ω,?uF)
9. 立即加1ml预冷的SOC,37゜C诱导培养40min(如需在同一库斯质粒上中断基因,则30゜C诱导培养)。
10. 涂LA(含100ug/ml Amp及与电转片段携带的抗性标记相应的抗生素)平板,37゜C过夜培养。(转化子中含有两种质粒,分别是重组前和重组后的质粒,所以要抽质粒再转化一次DH5a)
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