6.5 转染QBI-293A细胞
表现 可能原因 解决方法
无空斑 a) 制备的质粒质量差 用氯化铯密度梯度法纯化用于转染的质粒
b) 时间问题 弃去培养板之前先等2~3周或更长。空斑将在2~3周内逐渐形成,如果重组子高表达蛋白,这个过程将更慢
c) 转染操作 用阳性对照来检验转染效率
d) 细胞拮抗腺病毒 从细胞库中复苏另一管细胞
e) 病毒质粒未经 PacI线性化 闭环质粒不会形成病毒空斑,转化前必须用PacI进行线性化
空斑太多 高转染效率导致空斑密度过高 由于太多数被转染细胞都将产生病毒空斑(79.5%),转染时请使用较少量的腺病毒DNA
转染后细胞高死亡率 a) 转染后钙离子未彻底去除 转染后先后用PBS/EDTA和PBS各洗一遍,去除钙离子
b)转染后细胞经胰酶消化 细胞在转染后非常脆弱,极易从壁上脱落。不要使用胰酶进行消化,这样做不仅不必要,而且还可能导致活着的细胞死亡
覆盖的琼脂糖不清澈 琼脂糖被污染 使用无菌的琼脂糖
6.6筛选和测定
表现 可能原因 解决方法无重组子 a) 挑中了背景空斑(即首先出现或最大的空斑) 挑空斑之前先等14~17天.
b) 达到或超过了载体的最大克隆能力 确认是否超过最大克隆能力;若有疑问请联系技术支持(info@qbi.com)
c) 插入基因产物有毒 在293细胞中暂时性表达蛋白以评价气度性。若有毒,请替换未可诱导或较弱的启动子
d)插入基因缺失 重组时因某些未知原因可能导致基因缺失,应筛选较多的克隆
扩增后插入基因丢失 有RCA,当大量扩增时可能发生回复突变 1)检测是否含有RCA或感染非允许细胞
2)联系技术支持,请教如何检测和限制这一现象
3)用原始病毒保存液重新空斑纯化病毒
重组时将插入基因丢失 用原始病毒保存液重新扩增
6.7 在QBI-293A细胞中表达
表现 可能原因 解决方法
重组蛋白不表达 a)基因未插入重组病毒 用病毒保存液进行PCR反应,检测是否含有目的基因
b)表达水平太低,所用方法无法检测到 优化检测蛋白表达的条件
蛋白表达水平太低 a)蛋白表达的克隆设计不够优化,如非翻译区太长、离启动子太远等等 选择最佳蛋白表达克隆。这些因素在进行克隆设计时就应考虑到
b)启动子不太适合在所用的细胞类型中表达蛋白 用另一类型细胞验证蛋白表达情况
6. 8 重组腺病毒的扩增
表现 可能原因 解决方法
病毒溶液终浓度低 病毒增值速度慢,这和很多因素有关,如插入基因的大小、毒性和重组情况等等 1) 感染时间从48小时增加到72小时,以产生完全的CPE
2) 保证三次冻融都很完全
3) 如果需要,用更大的培养器皿和更多的细胞进行更大量的扩增(代数不能太多)
6. 9 纯化
表现 可能原因 解决方法
第一次氯化铯离心后无条带形成 a) 收集的细胞量太少
b)病毒量太多 1) 感染的细胞量不够。至少需要3×108细胞,当病毒生长缓慢时则需更多细胞
2) 降低稀释度
上样量密度过大将使分离失效,适当稀释上样液
第二次氯化铯离心后无条带形成 第一步操作不当导致病毒丢失 吸取病毒带时必须非常小心,宁可吸到污染的杂质也不要漏吸,第二步将会去除污染的缺陷性颗粒第二次离心后条带分离不清晰 a) 氯化铯密度梯度制备质量差
b) 离心问题 1) 连续密度梯度必须使用密度梯度发生器小心制备,离心前切勿将梯度打乱
2) 稀释第一步中得到的病毒带
3) 不要使用直径比推荐值小的离心管,否则条带将变大
检查离心记录,速度和时间都会影响分离效果
6.10 病毒滴度测定
表现可能原因 解决方法
OD260测得的滴度与空斑测定或TCID50测定获得的滴度无相关性 a) 含有大量缺陷性颗粒
b) 稀释错误
c) 细胞密度不够 用两次氯化铯离心纯化病毒,去除缺陷性颗粒 精确测定滴度时,每个稀释度都应有复孔,稀释时必须换用枪头
进行滴度测定时细胞必须50~60%汇合
无CPE或空斑 a) 保存液滴度太低,无法检测到
b) 时间问题 1) 使用阳性对照,以确保方法和溶液的有效性
2) 降低保存液的稀释度
在推荐时间内等待空斑形成和CPE出现 保存后滴度降低 缓冲液不对或储存不当 1) 使用含2mMgcl2和5%蔗糖的10mM Tris缓冲液,PH8.0,PH值对于长期保存至关重要
2) 将病毒保存于-80℃,不主张长期保存于-20℃
3) 将病毒分装成小份,以免反复冻融后降低滴度
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