小RNA病毒的不同属和不同成员之间的区别,主要在于病毒RNA分子内核苷酸一级结构的不同。其结果,病毒蛋白内氨基酸残基的排列顺序不同,从而导致不同的抗原性及其在各种细胞内的不同的生长能力,其对pH的抵抗力和在氯化铯中的浮密度也不相同。小RNA病毒呈L434结构,病毒RNA指导合成一条完整蛋白,在特定酶的作用下,分解成L、P1、P2和P3产物。P1、P2和P3又进一步分别分解为4个(VP1~VP4)、3个(2A~2C)和4个(3A~3D)最终蛋白产物。P1又称1ABCD,VP1~VP4相当于1D、1B、1C和1A。小RNA病毒衣壳构造的基本元件为蛋白亚单位,每个亚单位分别由1个VP1、VP2、VP3和VP4分子组成。VP1、VP2和VP3位于病毒粒子的表面,VP4位于衣壳内侧,紧贴于VP1、VP2、VP3复合体。亚单位以5 对称轴首先形成五聚体,再由12个五聚体形成病毒衣壳。 图16-1 小RNA病毒(鼻病毒)亚单位结构模式多数小RNA病毒的衣壳表面粗糙不平,其凹凸差别可达25nm。在距5对称轴约30nm附近,病毒表面突然下凹,形成一个围绕5对称轴的大“渠沟”,称为峡谷(Canyon),峡谷是受体结合部位,细胞受体ICAM1插入此谷,与谷底氨基酸发生接触。峡谷下约05~10nm处有一空洞(Pocket),与峡谷相通。某些抗病毒化合物可以进入此洞,造成局部构型变化,使病毒峡谷底部完全失去同ICAM1受体结合的能力,病毒不能脱壳,从而抑制病毒复制。
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