仅有少数多肽抗生素是通过正常的蛋白质合成系统经转录和翻译得到的。一般由细菌产生，但也有少数是放线菌产生的。它们的结构中含有羊毛硫氨酸（Lanthionine），因此又称为Lantibiotics。核糖体合成的抗生素分子比较大，如含19个氨基酸残基的血管紧张肽转化酶抑制肽（Ancovenin）和含34个氨基酸残基的乳链菌肽（Nisin）。新制癌菌素（Neocarzistatin）有100多个氨基酸残基，而且与一个复杂的发色基团结合，实际上是一种蛋白质类抗生素。这些多肽类抗生素的前体有一段导肽，须在翻译后加工时切除，然后再经过对氨基酸残基的修饰反应而获得最终产物。

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