氰细菌（又名蓝绿藻，Cyanobacteriaceae）与其他类型的光养型细菌不同之处是它们在光合作用中甚至能利用水作为电子供体，最终产物是氧气。紫色和绿色细菌不能进行产氧的光合作用，而需要在厌氧条件下才能光养生长，它们的电子供体的氧化还原势比水还要低，如还原态的硫化物、氢或小的有机分子等。绿色光养型细菌分为两类：绿菌科（Chlorobiaceae）和滑行丝状绿色硫细菌（Chloroflexaceae），两者都是硫细菌；紫色菌也分为两类：红硫菌科（Chromatiaceae）和红螺菌科（Rhodospirillaceae）。氰细菌和Rhodospirillaceac利用硫化物或硫代硫酸盐作为电子供体，但不会利用硫，而且在自然界中的数量比Chlorobiaceae和Chromatiaceae要少得多，对Chloroflexaceae的了解比较少，是一类绿色的、嗜热的滑动菌。Chlorobiaceae和Chromatiaceae的差别表现在超微结构、细菌叶绿素和二氧化碳固定方式的不同。Chlorobiaceae还缺少Clavin循环。

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