由于Umezawa实验室的出色工作，从链霉菌中分离出了一系列的蛋白酶抑制剂。亮抑蛋白酶肽Leu-peptin和β-MAPI分别是末端的羧基已经还原为醛基的三肽和四肽，是丝氨酸蛋白酶的抑制剂。有些抑制剂能与细胞表面上的蛋白酶作用，具有免疫强化作用。如佳制霉素Bestatin是一种由S.olivoreticili产生的二肽，在白血病和黑色素瘤的治疗中正在进行临床试验。用于农业和饲养业的多肽类抗生素有维吉尼亚霉素S和M1（Virginiamycin S&M1），前者是一个环六肽，后者则具有肽内酯结构。另一种作为饲料添加剂的硫链丝菌肽（Thiosestrepton）分子结构中有多个噻唑和杂环基团。在基因工程和分子生物学中常用作硫链丝菌肽抗性标记。由S.viridochromogenes分离得到的Bialaphose是一个含两个丙氨酸分子和磷丝菌素（phosphinotricin）的三肽类似物，其结构中的磷丝菌素部分能抑制谷氨酰胺合成酶，因此具有抗菌和杀虫活性。

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