担子菌的菌丝发育良好，且有分隔，往往扩展生成扇形，通常为白色、鲜黄色或橙黄色。菌丝体具三个明显的发育阶段：初生菌丝（primary mycelium）二生菌丝（secondary mycelium）和三生菌丝（tertiary mycelium）。
初生菌丝为单倍体（n），是由单核的担孢子萌发而成，初期为多核，而后即产生分隔，把菌丝体分成单倍体（单核）。二生菌丝为双核体（n+n），它从初生菌丝发育而成。两个单核细胞进行异宗配合，发生质配后，并不马上核配，成为具双核细胞的二生菌丝。二生菌丝以锁状联合方式增殖细胞。两个核同时分裂，由“锁状联合机制”控制形成两个子细胞，每个子细胞具有两个不同的子核。二生菌丝可独立营养并占据生活史的大部分。锁状联合过程包括以下步骤：
① 菌丝的双核细胞开始分裂之前，两核之间生出一钩状分枝；
② 细胞内一个核进入钩中；
③ 两核同时分裂成4个核；
④ 新分裂的两个核移入到细胞的一端，一个核仍留在钩中；
⑤ 钩向下弯曲与原细胞壁接触，接触处的壁溶解而沟通，同时钩的基部产生隔膜；
⑥ 钩中的核向下移，在钩的垂直方向产生一隔膜，一个细胞分成两个细胞，每个细胞具有两个不同的子核，锁状联合完成。
三生菌丝也是双核体（n+n），由二生菌丝特化形成。特化菌丝形成各种子实体(fruit body)，而子实体是真菌产生孢子的构造，由繁殖菌丝和营养菌丝组成，其形态因种而异，如蘑菇、香菇等子实体呈伞状，由菌盖、菌柄和菌褶等组成。菌褶处着生担子和担孢子。
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