霉菌基因重组的主要方式是通过有性生殖过程完成，即两个来源不同的孢子发生质配、核配，形成重组体细胞。而有些霉菌的基因重组则可以采取另一种形式——准性生殖。顾名思义，准性殖是一种类似于有性生殖，但比它更原始的生殖方式。准性生殖可发生在同一生物的两个不同来源的体细胞之间，经细胞融合但不发生减数分裂，导致低频率的基因重组。准性生殖常见于些真菌，尤其是半知菌类。

准性生殖主要过程包括菌丝联结、异核体形成、核融合、体细胞交换及单倍体化。

菌丝联结发生在一些形态上无区别，但遗传特性有差别的两个同种亲本的体细胞之间，发生的频率较低。菌丝联结后，细胞核由一根菌丝进入另一根菌丝，从而形成含两种或两种以上基因型的异核菌丝，称异核体。异核体能独立生活，而且生活能力往往更强。异核体中的两个核偶尔会发生核融合或核配，形成杂合双倍体。它较异核体稳定，产生的孢子比单倍体菌丝产生的孢子大一倍。构巢曲霉和米曲霉发生核融合的频率为10^-7~10^-5，某些理化因素如樟脑蒸汽，紫外线或高温处理等，可以提高核融合的频率。

杂合双倍体在有丝分裂过程中，其中极少数核内染色体会发生交换，这一过程称为体细胞交换，并可能以单倍体数量的染色体进入新细胞，即单倍体化，产生具有新形状的单倍体杂合子。若对杂合双倍体进行紫外线，γ射线或氮芥等处理，可促进染色体畸变或染色体在子细胞中分配不均，可能产生各种不同性状组合的单倍体杂合子。

准性杂交就是利用半知菌类的准性生殖，在一定的条件下促使不同形状的亲本杂交来获取新品种的过程。对于一些没有有性生殖过程但有重要生产价值的半知菌来说，准性杂交是一条重要的育种途径。

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