古生菌的细胞膜有着自己的独特性，这也是细菌细胞膜多样性的体现，古生菌细胞膜的特点主要有：

  （1）古生菌的疏水尾由长链烃组成，通常都是异戊二烯组成的重复单位；

  （2）古生菌的亲水头和疏水尾是通过醚键而不是酯键相连；

  （3）古生菌的细胞膜中存在着单分子层膜或单、双分子层混合膜，而真细菌或真核生物的细胞膜都是双分子层膜；

  （4）在古生菌甘油分子的C3位上，可以连接的基团具有多样性，例如，可连接磷酸酯基、硫酸酯基和多种糖基，这是与真细菌和真核生物细胞膜完全不同的；

  （5）古生菌的细胞膜上有着许多种特别的脂类，例如，仅在各种嗜盐菌中就有细菌红素、番茄红素、视黄醛等。

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